在半導體電子工業、醫藥行業、精密儀器工業和生物實驗室等對空氣有高品質要求的空調領城，通常將空氣過濾器與空調機組組合在一起，構成潔凈空調機組，一般有柜式凈化空調機組、組合空調機組和凈化新風機組三種類型。
1、柜式凈化空調機組
（1）結構原理
柜式空調機組是一種能提供恒溫恒濕，并對空氣進行凈化的空調機組。其外形像一個大立柜，機組自帶冷  源，包括壓縮機、冷凝器、換熱器、加熱器、加濕器、離心風機及自動控制裝置。在空調機組的回風口及出風口設有過濾器，并在過濾器前后設有壓差開關。
（2）分類
根據冷凝器的冷卻方式可分為水冷和風冷兩種，根據用途則分為冷風機、冷熱風機和恒溫恒濕機。
（3）特點
在恒溫恒濕的基礎上，能對空氣進行凈化處理，使潔凈空調系統簡單化。設在回風口的過濾器為一級過濾器 （粗效），一般采用平板過濾器或袋式過濾器；設在出風口處的過濾器為二級過濾器（高中效），一般采用W形密摺式過濾器或無隔板過速器。
（4）應用
柜式凈化空調機組適用于對空氣潔凈度要求較高的場合，一般需在末端安裝高效、亞高效空氣過濾器，可以根據需要做成計算機房專用空調機組、手術室專用空調機組，配置符合要求的空氣過濾器。 
2、組合空調機組
（1）結構原理
組合空調機組由不同的功能段(空氣處理段)組合而成，可以根據潔凈區的需要選擇不同的功能段，一般有以下幾段：新回風混合段(帶調節閥)、粗效過濾器段、加熱段、表面冷卻段、加濕段、二次回風段、過渡段、風機段、消聲段、熱回收段、高中效過濾器段和出風段。
（2）分類
組合空調機組可分為一般工業用組合空調機組和醫用組合空調機組。醫用空調機組將熱交換盤管設置在正壓段，消除了盤管積水不易排走的弊端，杜絕了因積水而滋生細菌、污染和臭氣；醫用組合空調機組采用親水膜平翅片，防止鋁箔表面形成小水珠，減少了氣流中的水滴，平翅片也不易積塵滋菌；將高中效空氣過濾器設在風機后的均流板與盤管之間，使中效空氣過濾器滿足機組正壓段的要求，保護蒸發盤管，減少了積塵和積菌；采用吹風或特殊自循環的消毒辦法，使表冷器等易帶菌部分保持無菌。
（3）特點
組合式空調器不帶制冷壓縮機，需由制冷系統供給冷媒。組合空調機組可根據需要進行功能段組合，使用靈活。
（4）應用
組合式空調機組應用于空氣潔凈度要求高的場合，需要在送風器末端安裝高效、亞高效空氣過濾器；醫用組合空調機組必須采取滅菌、消毒措施。
3、凈化新風機組
（1）結構原理
凈化新風機組是一種能提供恒溫恒濕，并對新風進行三級過濾的空調機組。在室外新風含塵濃度高時，若只對新風進行粗效過濾，會加重潔凈系統高中效空氣過濾器的過濾負荷，影響室內空氣品質。
（2）特點
新風的三級過濾(粗效、中效、亞高效)保護了潔凈系統的高中效空氣過濾器，新風過濾器面積小，維護管理方便，增加費用小。